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Episode 101 : Pilot (48 Heures)
Meredith Grey, fille de la célèbre chirurgienne Ellis Grey est actuellement en train de se réveiller après une nuit bien arrosé avec une liaison sans lendemain. Elle chasse son compagnon d'un soir, Derek, prétextant qu'elle sera en retard pour son premier jour de travail. Elle est interne en première année à l'hôpital Grace de Seattle où elle y travaillera aux côtés de personnages haut en couleurs. Cristina Yang, diplômé de Stanford, fortement compétitive qui devient amie avec Meredith. George O'Malley est un homme peu sûr de lui qui dès son premier jour se fait se fait remarquer par ses erreurs. Izzie Stevens est un ancien top model qui n'obtient pas de traitement de faveur pour son premier jour. Et Alex Karev, l'interne arrogant qui diagnostique mal son premier patient. La résidente en charge des nouveaux internes, Miranda Bailey, est appelée "affectueusement" 'le tyran' pour son légendaire traitement des internes. Meredith a une belle surprise lorsqu'elle se rend compte que son aventure d'un soir est un chirurgien et pire encore, son patron.
Episode 201 : Raindrops Keep Fallin' on my Head (Surveillance rapprochée)
Meredith essaye de s'addapter avec le fait qu'elle doit travailler avec Addison Shepherd. Webber ordonne à George d'être ses yeux et ses oreilles à l'hôpital pendant qu'il est en convalescence car il s'est rendu compte que beaucoup de choses lui avaient échappé. Meredith et Cristina se retrouvent au bar "Emerald City" pour discuter de leurs vies respectives. Cristina reconsidère sa relation avec Burke en essayant de prendre une décision tandis que Meredith est dévastée par le fait que Derek ne l'ait pas choisi. Tout à coup, Joe le barman s'éffondre sous leurs yeux...
Episode 301 : Time Has Come Today (Avec le temps)
C'est le lendemain du bal et tout le monde s'inquiète pour Izzie, qui pleure toujours Denny. Elle est allongée sur le sol de la salle de bain et refuse de manger ou de se changer et enlever sa robe. Cristina dit à Meredith qu'elle est la mieux placée pour récomforter Izzie. Bailey reste avec le corps de Denny jusqu'à ce qu'on vienne le chercher. Meredith avoue à Cristina que durant le bal, elle a couché avec Derek, mais elle ne sait plus oû ils en sont. Adèle prend rendez-vous avec Richard, disant que c'est la seule façon qu'elle a de le voir. Elle lui pose un ultimatum : soit il prend sa retraite soit elle le quitte. Omar et sa femme, Giselle, arrivent aux urgences. Elle les a amené à l'hôpital pour cause de grippe. Derek et George, chargés de ca cas, découvrent en réalité qu'il a été exposé à la peste bubonique. La Quarantaine est déclarée et Derek et George se retrouvent seuls tous les deux dans les vestaires.
Episode 401 : A Change is Gonna Come (Le vent du changement)
Alors qu'elle vient de rentrer de sa lune de miel, qu'elle a passé avec Meredith, Cristina cherche Burke mais ne le trouve nul part. Meredith, Cristina, Izzie et Alex commencent leur première année en tant que résident et auront maintenant des internes sous leurs ordres. Parmi ces nouveaux internes, se trouvent George, qui doit refaire son internat après avoir échoué à ses examens, et Lexie Grey, la demi-soeur de Meredith. Alors que sa relation avec Meredith se trouve dans une impasse, Derek compte sur l'amitié des autres médecins. Bailey lutte pour trouver sa place dans l'hôpital maintenant que ses anciens internes doivent se référer au chef des résidents : Callie. Quand à Richard, il reprend son poste de chef.